過去問の問題部分は絶対にコピーして使ったほうがいいです。
現在、市販されている過去問はサイズ的に非常に使いにくいですし、
直接書き込んでしまうと、後々の利用に差し支えてしまいますね。

過去問は、長期間にわたって使うことになるので、
問題の部分は、絶対にコピーして使ったほうがいいです。

何回も何回も使うことになるため、書き込みがあると邪魔になりますし、
何よりも、過去問集をそのまま使おうとすると、非常に使いにくいです。

そもそも、赤本や青本は、ズングリムックリで、かなり使いにくい形状をしているので、
コピーして使わないと、問題演習がしにくかったりします。

文字が小さくて読みづらかったりもするので、
入試標準のＡ４サイズくらいに、拡大コピーするといいでしょう。
（入試の問題冊子は、たいていＡ４サイズです。）

個人的には、赤本や青本も、かつての緑本のようにＡ４サイズにしてくれると
受験生も使いやすいんじゃないかと思ってたりします。

また、逆に、解答･解説部分はコピーしないで、直接書き込んだほうがいいと思います。

ここの部分への書き込みというのは、ある意味、受験生の財産になります。

どこら辺がわからなかったとか、こういう知識が必要になるのか、など
気づいたことや感じたことをバンバン書き込みましょう。

後で見返したときに、かなり役に立つと思いますよ。